三人調查小組開始研究各種奇怪的事件。隨著事情變得越來越困難，聯邦調查局女特工奧利維亞·鄧納姆和高智商天才彼得·畢肖普將聯手對抗令人難以置信和可怕的現象。為了防止危機進一步蔓延，但偶爾也會向奧利佛等人提供一些幫助，首先是從即將墜毀的飛機開始。緊急迫降後，機上所有人均死於神秘病毒，聯邦調查局和各方調查小組介入調查。但這只是故事的開始，沃爾特‧畢肖普博士背後不為人知的一面正在慢慢揭開。片中看到的一家名為Massive Dynamic的先進科技公司，也與Walter Bishop博士有著深厚的淵源，真相將會慢慢水落石出。故事的開頭就像《迷失》，這進一步混淆了它的真正目的。喬寧集團究竟是不惜一切代價拯救人類的正義天使，還是企圖將整個地球變成一個可以為所欲為的實驗室的幕後黑手？它的創始人曾與他在同一個實驗室工作，與奧利佛等人進行深入研究。然而俊英的神秘舉動卻讓人懷疑與一系列神秘事件脫不了乾系。他們將向彼得關係疏遠的父親尋求幫助。他的父親沃爾特·畢夏普博士被送進精神病院。出院後